- Questa canzone è stata interpretata per parlare dei problemi nell'Irlanda del Nord, ma Dave Mustaine ha indicato che la canzone parla di Israele (la madre di Mustaine è ebrea sebbene sia cristiana). In un'intervista con Rock Detector, Mustaine ha dichiarato: 'Holy Wars' non parla di un luogo specifico nel tempo. Non parla di nessun paese. Dice solo: 'Non guardare ora a Israele, potrebbe essere la TUA patria'.
Alla Israel National Radio, Mustaine ha detto: 'Ho già menzionato Israele nelle canzoni, in 'Holy Wars'. Le guerre sante non devono necessariamente iniziare in Israele. Può essere ovunque. In ogni caso, ci sono così tante guerre sante che si stanno svolgendo nel mondo in questo momento. Le persone stanno morendo per una causa. È così incredibile. - Mustaine ha spiegato che la seconda metà della canzone è stata ispirata dal fumetto Il Punitore , che ama (la canzone dei Megadeth ' Killing Is My Business... and Business is Good ' parla di Il Punitore ). Per quanto riguarda la prima parte, ha spiegato quando l'album è stato pubblicato per la prima volta che si trattava di un'esperienza accaduta in Irlanda. Mustaine ha detto: 'Avevo scoperto che l'IRA non era apparentemente contraria agli inglesi come mi è stato detto. Eppure il modo in cui mi è stato descritto era molto annacquato. Così, mentre ero lì, mi sono sparato la bocca, dicendo: 'Questo è per la causa! Anarchia in Irlanda! Restituisci l'Irlanda agli irlandesi!' Ho catturato un sacco di critiche dalla stampa inglese, e ho preso molto da quella irlandese... e come se me ne frega un cazzo per l'IRA!'
